Report 20 - Using mobility to estimate the transmission intensity of COVID-19 in Italy: A subnational analysis with future scenarios
Key info
Date:
04 May 2020
Authors:
Michaela A. C. Vollmer, Swapnil Mishra, H Juliette T Unwin, Axel Gandy, Thomas A. Mellan, Valerie Bradley, Harrison Zhu, Helen Coupland, Iwona Hawryluk, Michael Hutchinson, Oliver Ratmann, Melodie Monod, Patrick Walker, Charlie Whittaker, Lorenzo Cattarino, Constance Ciavarella, Lucia Cilloni, Kylie Ainslie, Marc Baguelin, Sangeeta Bhatia, Adhiratha Boonyasiri, Nicholas Brazeau, Giovanni Charles, Laura V Cooper, Zulma Cucunuba, Gina Cuomo-Dannenburg, Amy Dighe, Bimandra Djaafara, Jeff Eaton, Sabine L van Elsland, Richard FitzJohn, Keith Fraser, Katy Gaythorpe, Will Green, Sarah Hayes, Natsuko Imai, Ben Jeffrey, Edward Knock, Daniel Laydon, John Lees, Tara Mangal, Andria Mousa, Gemma Nedjati-Gilani, Pierre Nouvellet, Daniela Olivera, Kris V Parag, Michael Pickles, Hayley A Thompson, Robert Verity, Caroline Walters, Haowei Wang, Yuanrong Wang, Oliver J Watson, Lilith Whittles, Xiaoyue Xi, Azra Ghani, Steven M Riley, Lucy Okell, Christl A. Donnelly, Neil M Ferguson1, Ilaria Dorigatti1, Seth Flaxman, Samir Bhatt1
1Correspondence:
neil.ferguson@imperial.ac.uk
i.dorigatti@imperial.ac.uk
s.bhatt@imperial.ac.uk
WHO Collaborating Centre for Infectious Disease Modelling, MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, Abdul Latif Jameel Institute for Disease and Emergency Analytics, Imperial College London
Summary
Italy was the first European country to experience sustained local transmission of COVID-19. As of 1st May 2020, the Italian health authorities reported 28,238 deaths nationally. To control the epidemic, the Italian government implemented a suite of non-pharmaceutical interventions (NPIs), including school and university closures, social distancing and full lockdown involving banning of public gatherings and non essential movement. In this report, we model the effect of NPIs on transmission using data on average mobility. We estimate that the average reproduction number (a measure of transmission intensity) is currently below one for all Italian regions, and significantly so for the majority of the regions. Despite the large number of deaths, the proportion of population that has been infected by SARS-CoV-2 (the attack rate) is far from the herd immunity threshold in all Italian regions, with the highest attack rate observed in Lombardy (13.18% [10.66%-16.70%]). Italy is set to relax the currently implemented NPIs from 4th May 2020. Given the control achieved by NPIs, we consider three scenarios for the next 8 weeks: a scenario in which mobility remains the same as during the lockdown, a scenario in which mobility returns to pre-lockdown levels by 20%, and a scenario in which mobility returns to pre-lockdown levels by 40%. The scenarios explored assume that mobility is scaled evenly across all dimensions, that behaviour stays the same as before NPIs were implemented, that no pharmaceutical interventions are introduced, and it does not include transmission reduction from contact tracing, testing and the isolation of confirmed or suspected cases. Some of these factors, such as contact tracing, are likely to be introduced and will contribute to reductions in transmission; therefore our estimates should be viewed as pessimistic projections. We find that, in the absence of additional interventions, even a 20% return to pre-lockdown mobility could lead to a resurgence in the number of deaths far greater than experienced in the current wave in several regions. Future increases in the number of deaths will lag behind the increase in transmission intensity and so a second wave will not be immediately apparent from just monitoring of the daily number of deaths. Our results suggest that SARS-CoV-2 transmission as well as mobility should be closely monitored in the next weeks and months. To compensate for the increase in mobility that will occur due to the relaxation of the currently implemented NPIs, adherence to the recommended social distancing measures alongside enhanced community surveillance including swab testing, contact tracing and the early isolation of infections are of paramount importance to reduce the risk of resurgence in transmission.
Translations
中文 - Mandarin
2020年5月4日
报告20-以人群移动估算意大利COVID-19的传播强度:包含未来情景的国家以下层级分析
意大利是第一个经历持续的COVID-19本地传播的欧洲国家。截至2020年5月1日,意大利卫生当局报告全国有28,238人死亡。为控制流行,意大利政府实施了一系列非药物干预措施(NPI),包括关闭学校和大学,社交隔离以及包括禁止公共聚会和非必要运动在内的全面封锁。在此报告中,我们使用平均迁移率数据,建模研究NPI对COVID-19传播的影响。我们估计,目前所有意大利地区的平均再生数(传播强度度量)均低于1,且大多数地区的估计呈现显着结果。尽管死亡人数众多,但在所有意大利地区,被SARS-CoV-2感染的人口比例(罹患率)仍远未达到群体免疫阈值,其中以伦巴第地区所观察到的罹患率最高(13.18% [10.66%-16.70%])。意大利将从2020年5月4日开始放宽目前实施的NPI。在疫情已随着NPI的实施而得到控制下,我们考虑了未来8周的三种情况:人群移动保持封城期间的情况,人群移动恢复至封城前20%的情况,和人群移动恢复至封城前40%的情况。这些探索的情景假设人群移动在所有层面上均等地缩放,即行为与实施NPI之前相同,未引入任何药物干预措施,并且不包括因接触者追踪,检测及隔离确诊或疑似病例而减少的传播。其中一些因素,例如接触者追踪,可能会被引入并将有助于减少传播;因此,我们的估计应被视为悲观的预测。我们发现,在没有采取其他干预措施的情况下,即使恢复封城前人群移动的20%,也可能导致死亡人数再度上升,远远超过当前这波几个地区的死亡人数。未来死亡人数的上升将延迟出现于传播强度增加之后,因此仅从每日死亡人数的监测,第二波将不会立即显现。我们的结果表明,应在接下来的几周和几个月内密切监视SARS-CoV-2的传播和人群移动。为了补偿由于放松当前实施的NPI而导致的人群移动增加,遵守建议的社交隔离措施以及提升的社区监测(包括拭子检测、接触者追踪和感染者及早隔离)对降低传播反弹的风险至关重要。
日本語 - Japanese
2020年5月4日
レポート20 - イタリアにおける新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の伝染強度を推定するためのモビリティの利用:国家レベルでの分析および将来のシナリオ
イタリアは、欧州で初めてCOVID-19の持続的な局所感染を経験した国です。2020年5月1日現在、イタリアの保健当局は全国の死亡者数を28,238人と報告しています。流行を抑制するため、イタリア政府は、学校や大学の閉鎖、社会的距離の確保、公共の集まりや不要不急の移動の禁止など、完全な都市封鎖を含む、一連の非医薬品介入(NPI)を実施しました。本レポートでは、平均的な移動量に関するデータを使用して、NPIが伝染に与える影響をモデル化しています。その結果、平均再生産数(感染強度の指標)は、現在イタリアの全地域で1を下回っており、大多数の地域では有意に下回っていると推定されています。死亡者数は多いものの、新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)に感染した人口の割合(感染率)は、イタリアの全地域で集団免疫の閾値を大きく下回っており、最も感染率が高いのはロンバルディア州(13.18%[10.66%〜16.70%])でした。イタリアでは、現在実施中のNPIは、2020年5月4日から緩和される予定です。NPIで達成された抑制を考慮し、今後8週間のシナリオとして、移動量が都市封鎖中と比べて変化がない場合、都市封鎖前の20%の水準まで回復した場合、都市封鎖前の40%の水準まで回復した場合の3つを検討しました。ここで検討したシナリオは、移動量があらゆる方向に均等に拡大することや、NPIの実施前と同じ行動が維持されること、医薬品による介入が行われないことを仮定しており、接触者追跡や、検査、感染が確認された患者や感染疑いの患者の隔離による感染の減少は含まれていません。接触者追跡など、上記のいくつかの要因は導入される可能性が高く、感染の減少に役立つと考えられるため、私たちの推計は悲観的な予測とみなす必要があります。追加の介入が行われない場合、移動量が都市封鎖前の20%の水準に回復しただけでも、一部の地域では第一波で発生した死亡者数をはるかに上回る死亡者数につながりうることが分かりました。今後の死亡者数の増加は伝播強度の上昇よりも遅れて発生するため、日々の死亡者数を観察するだけでは第二波の発生をただちに発見することはできません。私たちの調査結果は、移動量やSARS-CoV-2の伝播を今後数週間から数か月間注意深く監視する必要があることを示しています。現在実施中のNPIの緩和に伴う移動量の増加に対応し、感染症の再発リスクを低減するには、拭き取り検査や、接触者追跡、感染者の早期隔離などのコミュニティ監視の強化に加え、社会的距離の確保の遵守が最も重要だと考えられます。
Español - Spanish
4 de mayo de 2020
Informe 20 - Uso de la movilidad para estimar la intensidad de transmisión de la COVID-19 en Italia: un análisis subnacional con escenarios futuros
Italia fue el primer país europeo en experimentar una transmisión local sostenida de COVID-19. A 1 de mayo de 2020, las autoridades sanitarias italianas informaron de 28.238 muertes a nivel nacional. Para controlar la epidemia, el Gobierno italiano implementó un conjunto de intervenciones no farmacológicas (INF), incluidos los cierres de escuelas y universidades, el distanciamiento social y el confinamiento total, que implicaban la prohibición de las reuniones públicas y la movilidad no esencial. En este informe modelizamos el efecto de las INF en la transmisión utilizando datos sobre la movilidad media. Estimamos que el número medio de reproducción (una medida de la intensidad de la transmisión) está actualmente por debajo de uno en todas las regiones italianas, y significativamente en la mayoría de las regiones. A pesar del gran número de muertes, la proporción de población infectada por el SARS-CoV-2 (la tasa de ataque) está lejos del umbral de inmunidad de grupo en todas las regiones italianas, y la tasa de ataque más alta observada se registra en Lombardía (13,18 % [10,66 % - 16,70 %]). Italia va a relajar las INF actualmente implementadas a partir del 4 de mayo de 2020. Dado el control alcanzado por las INF, consideramos tres escenarios para las próximas 8 semanas: un escenario en el que la movilidad siga siendo la misma que durante el confinamiento, un escenario en el que la movilidad vuelva a los niveles previos al confinamiento en un 20 % y un escenario en el que la movilidad vuelva a los niveles previos al confinamiento en un 40 %. Los escenarios explorados presuponen que la movilidad se ajusta de manera uniforme en todas las dimensiones; el comportamiento permanece igual que antes de que se implementaran las INF; no se introducen intervenciones farmacológicas; y no se incluye la reducción de la transmisión por el rastreo de contactos, las pruebas y el aislamiento de los casos confirmados o sospechosos. Es probable que se introduzcan algunos de estos factores, como el rastreo de contactos, que contribuirán a reducir la transmisión; por lo tanto, nuestras estimaciones deben considerarse proyecciones pesimistas. Constatamos que, a falta de intervenciones adicionales, incluso un retorno del 20 % a la movilidad previa al confinamiento podría dar lugar a una reaparición del número de muertes mucho mayor que la experimentada en la oleada actual en varias regiones. Los futuros aumentos en el número de muertes se quedarán por detrás del aumento de la intensidad de la transmisión, por lo que no se apreciará inmediatamente una segunda oleada a partir de un simple seguimiento del número diario de muertes. Nuestros resultados indican que la transmisión del SARS-CoV-2 y la movilidad deben monitorizarse de cerca en las próximas semanas y meses. Para compensar el aumento de la movilidad que se producirá debido a la relajación de las INF actualmente implementadas, la adhesión a las medidas de distanciamiento social recomendadas junto con una mayor vigilancia comunitaria, incluidas las pruebas de hisopos, el rastreo de contactos y el aislamiento temprano de contagios, son de suma importancia para reducir el riesgo de reaparición de la transmisión.
Français - French
4 mai 2020
Rapport 20 - Utilisation de la mobilité afin d’estimer l’intensité de transmission de la COVID-19 en Italie : une analyse infranationale avec des scénarios futurs
L’Italie a été le premier pays européen à connaître une transmission locale soutenue de la COVID-19. À la date du 1er mai 2020, les autorités sanitaires italiennes avaient fait état de 28 238 décès à l’échelle nationale. En vue de contrôler l’épidémie, le gouvernement italien a mis en œuvre une série d’interventions non médicamenteuses (INM), notamment la fermeture des établissements scolaires et des universités, la distanciation sociale et le confinement total, impliquant l’interdiction des rassemblements publics et des déplacements non essentiels. Dans ce rapport, nous modélisons l’effet des INM sur la transmission à l’aide des données relatives à la mobilité moyenne. Nous estimons que le nombre moyen de reproduction (une mesure de l’intensité de la transmission) est actuellement inférieur à un pour toutes les régions italiennes, et sensiblement à ce stade pour la majorité des régions. En dépit du grand nombre de décès, la proportion de la population contaminée par le SRAS-CoV-2 (le taux d’attaque) est loin du seuil d’immunité collective dans toutes les régions italiennes, le taux d’attaque le plus élevé étant observé en Lombardie (13,18 % [10,66 % - 16,70 %]). À partir du 4 mai 2020, l’Italie devrait assouplir les INM actuellement déployées. Compte tenu du contrôle obtenu grâce aux INM, nous envisageons trois scénarios pour les 8 prochaines semaines : un scénario dans lequel la mobilité reste la même que lors du confinement, un scénario dans lequel la mobilité revient aux niveaux d’avant confinement à hauteur de 20 % et un scénario dans lequel la mobilité revient aux niveaux d’avant confinement à hauteur de 40 %. Les scénarios étudiés partent du principe que la mobilité est répartie uniformément pour tous les aspects, que le comportement reste identique à celui observé avant le déploiement des INM, qu’aucune intervention médicamenteuse n’est introduite, et qu’elle n’inclut pas la diminution de la transmission par le traçage des contacts, les tests et l'isolement des cas confirmés ou présumés. Certains facteurs, tels que le traçage des contacts, seront probablement introduits et contribueront à réduire la transmission ; par conséquent, nos estimations devront être considérées comme des projections pessimistes. Nous constatons qu’en l'absence d’interventions supplémentaires, même un retour à hauteur de 20 % de la mobilité d’avant le confinement pourrait entraîner une résurgence du nombre de décès beaucoup plus importante que celle observée au cours de la vague actuelle, dans plusieurs régions. Les augmentations futures du nombre de décès seront devancées par l’augmentation de l’intensité de la transmission et une deuxième vague ne sera pas immédiatement perceptible du simple fait du suivi du nombre quotidien de décès. Nos résultats suggèrent que la transmission du SRAS-CoV-2, ainsi que la mobilité, devront être étroitement surveillées au cours des prochaines semaines et des prochains mois. Afin de compenser l’augmentation de la mobilité qui interviendra en raison du relâchement des INM actuellement mises en œuvre, le respect des mesures de distanciation sociale recommandées parallèlement à une surveillance communautaire renforcée, notamment les tests à l’aide d’un écouvillon, le traçage des contacts et l'isolement précoce des personnes contaminées, sont d’une importance capitale pour réduire le risque de résurgence de la transmission.
Italiano - Italian
4 May 2020 - Imperial College London
Report 20: Uso della mobilità per stimare l'intensità di trasmissione di COVID-19 in Italia: analisi a livello regionale e scenari futuri
Report 20 COVID-19 2020-05-04 Italian (pdf)
Riassunto
L’Italia è stato il primo paese in Europa ad affrontare l’epidemia di COVID-19. Al 1° Maggio 2020, le autorità sanitarie italiane hanno riportato 28,238 decessi a livello nazionale. Per controllare l’epidemia, il governo italiano ha imposto una serie di interventi non-farmaceutici, tra cui la chiusura di scuole ed università, il distanziamento sociale e la quarantena, compreso il divieto di assembramenti pubblici e di effettuare spostamenti non essenziali. In questo rapporto, modellizziamo gli effetti degli interventi non-farmaceutici sulla trasmissione, utilizzando dati sulla mobilità media. Stimiamo che il numero medio di riproduzione (una misura dell'intensità di trasmissione) sia attualmente inferiore a uno per tutte le regioni italiane, e in modo significativo per la maggior parte di esse. Nonostante l’alto numero di decessi, la percentuale della popolazione che è stata infettata da SARS-CoV-2 (il tasso d’attacco) è lontana dalla soglia dell’immunità di gregge in tutte le regioni italiane, con il più alto tasso d’attacco osservato in Lombardia (13.18% [10.66%-16.70%]). L’Italia andrà a rilassare le attuali misure di contenimento a partire dal 4 Maggio 2020. Visto il controllo ottenuto ad oggi tramite l’implementazione dagli interventi non-farmaceutici, prendiamo in considerazione tre scenari per le prossime 8 settimane: uno scenario in cui la mobilità rimane la stessa della quarantena, uno scenario in cui la mobilità ritorna al 20% dei livelli pre-quarantena, e uno scenario in cui la mobilità ritorna al 40% dei livelli pre-quarantena. Gli scenari esplorati presuppongono che la mobilità venga riscalatain modo uniforme, che il comportamento rimanga uguale a quello precedente agli interventi non-farmaceutici, che non vengano introdotti interventi farmaceutici, e non include la riduzione di trasmissione tramite il tracciamento dei contatti, i test e l’isolamento di casi confermati o sospetti. Nuovi interventi, come l’aumento del numero di tamponi e il tracciamento dei contatti, contribuiranno verosimilmente alla riduzione della trasmissione; per questo motivo le nostre stime devono essere viste come proiezioni pessimistiche. Troviamo che, in assenza di ulteriori interventi, anche un ritorno del 20% ai livelli di mobilità pre-quarantena potrebbe causare un aumento dei decessi molto maggiore di quanto si sia verificato nell’attuale ondata, in diverse regioni. Futuri aumenti nel numero dei decessi verranno osservati dopo l’aumento dell’intensità di trasmissione e quindi una seconda ondata non sarà immediatamente evidente con il monitoraggio giornaliero dei decessi. I nostri risultati suggeriscono che sia la trasmissione di SARS-CoV-2, che la mobilità devono essere monitorate attentamente nelle settimane e nei mesi a venire. Per compensare l’aumento di mobilità che si verificherà con il rilassamento degli interventi non-farmaceutici attualmente in vigore, l'adesione alle misure di distanziamento sociale raccomandate insieme ad una sorveglianza intensificata della trasmissione nella comunità con tamponi, il tracciamento dei contatti e l’isolamento tempestivo degli infetti sono di fondamentale importanza per ridurre il rischio di ripresa della trasmissione.
Arabic - العربية
04 مايو 2020 - إمبريال كوليدج لندن
التقرير رقم 20 - استخدام حركة التنقل لتقدير كثافة انتقال فيروس كورونا المستجد (كوفيد-19) في إيطاليا: تحليل على مستوى بعض المناطق مع السيناريوهات المستقبلية
كانت إيطاليا أول دولة أوروبية تشهد موجة التفشي المتصاعد لفيروس كورونا المستجد. وحتى 1 مايو 2020، أبلغت السلطات الصحية الإيطالية عن 28,238 حالة وفاة على الصعيد الوطني. وللسيطرة على الوباء، نفذت الحكومة الإيطالية مجموعة من التدخلات غير الصيدلانية (NPIs)، شملت إغلاق المدارس والجامعات، والتباعد الاجتماعي، والإغلاق الكامل الذي تضمن حظر التجمعات العامة وتقييد الحركة غير الضرورية. في هذا التقرير، قمنا بنمذجة تأثير التدخلات غير الصيدلانية على معدل انتقال المرض باستخدام بيانات حول متوسط حركة التنقل.
نقدر أن متوسط رقم التكاثر (مقياس لمعدل انتقال العدوى) هو حاليًا أقل من واحد في جميع المناطق الإيطالية، وهو يشهد تراجعًا بشكل ملحوظ في غالبية المناطق. على الرغم من العدد الكبير للوفيات، فإن نسبة السكان الذين أصيبوا بفيروس كورونا المستجد (معدل الإصابات) ما تزال بعيدة عن عتبة مناعة القطيع في جميع المناطق الإيطالية، حيث لوحظ أعلى معدل للإصابة في لومباردي (13.18٪ [ 10.66٪ -16.70٪]).
ومن المتوقع أن تخفف إيطاليا من التدخلات غير الصيدلانية التي تم تنفيذها حاليًا اعتبارًا من 4 مايو 2020. وبالنظر إلى السيطرة التي حققتها التدخلات غير الصيدلانية، فسنحاول استعراض ثلاثة سيناريوهات خلال الأسابيع الثمانية القادمة: سيناريو تظل فيه حركة التنقل على ما هي عليه أثناء الإغلاق، وسيناريو تعود فيه حركة التنقل إلى مستويات ما قبل الإغلاق بنسبة 20٪، وسيناريو تعود فيه حركة التنقل إلى مستويات ما قبل الإغلاق بنسبة 40٪.
تفترض السيناريوهات التي تمت دراستها أن يتم تحجيم حركة التنقل بقدر متساو على جميع المستويات، وأن تظل السلوكيات على وضعها الذي كانت عليه قبل تنفيذ التدخلات غير الصيدلانية، مع عدم إضافة أي تدخلات صيدلانية، وهذا لا يتضمن تدابير تقليل انتقال العدوى عبر تتبع المخالطين، والاختبار وعزل الحالات المؤكدة أو المشتبه بها. ومن المحتمل أن يتم تطبيق بعض التدابير الإضافية مثل تتبع المخالطين، وهو ما سيسهم في خفض معدل انتقال العدوى: لذلك ينبغي النظر إلى تقديراتنا على أنها توقعات متشائمة.
في غياب التدخلات الإضافية، نجد أنه حتى عند عودة حركة التنقل بنسبة 20٪ إلى ما كانت عليه قبل الإغلاق، يمكن ترتفع الوفيات بمعدل أكبر بكثير مما شهدته الموجة الحالية في عدة مناطق. ومن الضروري ملاحظة أن الزيادات المستقبلية في عدد الوفيات قد لا تتزامن مع الزيادة في معدل انتقال الفيروس، وبالتالي لن يتم اكتشاف الموجة الثانية على الفور من مجرد رصد العدد اليومي للوفيات.
تشير النتائج التي توصلنا إليها إلى ضرورة رصد معدل انتقال عدوى فيروس كورونا المستجد، بالإضافة إلى حركة التنقل، عن كثب في الأسابيع والأشهر المقبلة.
ولتجنب التأثيرات التي يحتمل أن تنشأ نتيجة زيادة حركة التنقل بعد تخفيف التدخلات غير الصيدلانية المنفذة حاليًا، فإنه يتعين الالتزام بتدابير التباعد الاجتماعي الموصى بها إلى جانب تعزيز المراقبة المجتمعية، والحفاظ على اختبار المسحات وتتبع المخالطين والعزل المبكر للحالات المصابة، كونها تشكل أهمية قصوى في الحد من خطر عودة ظهور العدوى.